VMD(Visual Merchandising)是一種分子可視化程序,可以顯示、動畫演示和分析大的生物分子體系。VMD專為建模,可視化和分析生物系統(tǒng)(例如蛋白質(zhì),核酸,脂質(zhì)雙層組件等)而設(shè)計。由于VMD可以讀取標準蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(PDB)文件并顯示,因此可用于查看更通用的分子包含的結(jié)構(gòu)。
VMD軟件特色
VMD提供了多種用于渲染和著色分子的方法:簡單的點和線,CPK球體和圓柱體,甘草鍵,主干管和色帶,卡通繪圖等。VMD可用于對分子動力學(xué)(MD)模擬的軌跡進行動畫處理和分析。特別是,VMD可以通過在遠程計算機上顯示和模擬分子來充當(dāng)外部MD程序的圖形前端。
?VMD軟件亮點
VMD具有廣泛的應(yīng)用領(lǐng)域,它不僅可以用于生物化學(xué)領(lǐng)域,還可以用于材料科學(xué)、藥學(xué)、化學(xué)等領(lǐng)域。它可以幫助科學(xué)家們更好地理解分子的結(jié)構(gòu)和動態(tài)行為,從而更好地設(shè)計和開發(fā)新的藥物或材料。
VMD是一種強大的分子可視化軟件,可以用于顯示、動畫演示和分析大的生物分子體系。它具有廣泛的應(yīng)用領(lǐng)域,可以幫助科學(xué)家們更好地理解和設(shè)計新的藥物或材料。